Post-doctorant spécialisé en Machine-learning / Traitement d’Images médicales à Brest

Dans le cadre du programme de recherche hospitalo-universitaire FOLLOW-KNEE (financé sur 5 ans), et visant le développement d’une solution innovante pour le traitement de l’arthrose du genou, le consortium, piloté par l’Inserm et regroupant plusieurs partenaires industriels, institutionnels et cliniques, recrute un chercheur postdoctoral.

Le poste sera basé au LATIM (Laboratoire de Traitement de l’Information Médicale), unité mixte de recherche entre le CHRU Brest, l’UBO, l’IMT Atlantique et l’Inserm. Né de la complémentarité entre le domaine des Stic et de la Santé, le LATIM est nationalement et internationalement reconnu pour son expertise, sa contribution en imagerie médicale et la mise en œuvre de solutions innovantes en oncologie et thérapies interventionnelles.

L’objectif de ce postdoctorat est de développer et de mettre à la disposition des chirurgiens orthopédistes, un modèle morphologique et fonctionnel du genou. Le but de celui-ci sera de prédire, lors de la phase préopératoire et pour un patient donné, les résultats fonctionnels d’une stratégie chirurgicale pour le placement d’une prothèse totale de genou. La modélisation sera effectuée à partir d’une base de données hétérogène comprenant des IRM, des scanners, des radiographies et des données cinématiques. Le modèle devra être déformé et ajusté en fonction de certaines données spécifiques au patient traité.

Activités principales

  • Analyser et traiter un grand nombre de données multimodales (IRM, scanner, radiographies, cinématiques, …)
  • Créer à partir de ces données un modèle morpho-fonctionnel du genou
  • Valider ce modèle
  • Développer l’algorithme de déformation en prenant en compte les données associées au patient traité
  • Valider cet algorithme

Activités associées

  • Publier et disséminer les résultats de la recherche dans des journaux et congrès reconnus dans le domaine

Connaissances

  • Modèle statistique de forme ou modélisation d’apparence (Active Shape Models / Active Appearance Models)
  • Machine learning
  • Recalage multimodal
  • Développement logiciel (C++ et/ou Python) avec ITK, VTK, Scalismo/Statismo, Caffee ou TensorFlow

Savoir-faire

  • Piloter un projet de manière autonome
  • Assurer une veille / état de l’art du domaine scientifique
  • Apporter des réponses à des besoins spécifiques
  • Développer des algorithmes innovant dans le traitement de l’image médical
  • Communiquer et faire preuve de pédagogie

Aptitudes

  • Travail en équipe
  • Qualités relationnelles (interactions multiples avec cliniciens)
  • Créativité/Sens de l’innovation

Spécificité(s) / Contrainte(s) du poste

  • Expérience souhaitée
  • Expérience similaire de 1 à 5 ans

Diplôme(s) souhaité(s)

  • Doctorat
  • Domaine de formation souhaité : Vision par ordinateur Imagerie médicale

Structure d’accueil

  • Code unité LATIM – UMR 1101
  • Intitulé RHU FOLLOW-KNEE
  • Responsable M. Julien BERT et M. Guillaume DARDENNE

Composition

  • Adresse Institut Brestois de Recherche en Bio Santé (IBRBS) – 22, avenue Camille Desmoulins – Brest
  • Délégation Régionale Grand Ouest

Contrat

  • Type Contrat Postdoctral Inserm
  • Durée 18 mois
  • Rémunération
  • Date souhaitée de prise de fonctions Dès que possible

Pour postuler

Les candidatures, composées d’une lettre de motivation et d’un Curriculum Vitae, devront être adressées par voie électronique à : julien.bert@chu-brest.fr et guillaume.dardenne@chu-brest.fr